El Centro Nacional de Ciencias Aplicadas al Deporte del Estado Mérida, como Asociación Civil sin fines de lucro fue creado por el Instituto Merideño del Deporte y Recreación, registrado en fecha 30/09/2005; bajo el N° 16, folios 109 al 115, Protocolo 1, Tomo 5, Trimestre 3º, Años 2005. Actualmente funciona como un ente descentralizado del Instituto Merideño del Deporte, Actividad Física y Educación Física (IMDAFEF).